Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BPTFQ12830 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BPTFQ12830 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BPTFQ12830 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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