Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 HSP78YDR258C 2436 nt5.94□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 TOM20YGR082W 552 nt5.93□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.93□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 MRPL13YKR006C 795 nt5.93□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 YLR194CYLR194C 765 nt5.93□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 CNM67YNL225C 1746 nt5.93□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 VNX1YNL321W 2727 nt5.92□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 YLR122CYLR122C 378 nt5.92□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 HCR1YLR192C 798 nt5.92□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 TAL1YLR354C 1008 nt5.92□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 DAL82YNL314W 768 nt5.92□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 VMA4YOR332W 702 nt5.92□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 IMA2YOL157C 1770 nt5.92□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 EMW1YNL313C 2715 nt5.92□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 NOP7YGR103W 1818 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 DDC1YPL194W 1839 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 YGR176WYGR176W 348 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 SCO2YBR024W 906 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 CAR1YPL111W 1002 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 VMS1YDR049W 1899 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 RAP1YNL216W 2484 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 YAP1801YHR161C 1914 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 SEC18YBR080C 2277 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 ASN1YPR145W 1719 nt5.91□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 APM4YOL062C 1476 nt5.9□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 COX26YDR119W-A 201 nt5.9□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 MLC1YGL106W 450 nt5.9□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 GON7YJL184W 372 nt5.9□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 PIN2YOR104W 849 nt5.9□□□□□ -1.46
CTF3Q12748 BPL1YDL141W 2073 nt5.9□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 IMA5YJL216C 1746 nt5.89□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 TEA1YOR337W 2280 nt5.89□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 PGU1YJR153W 1086 nt5.89□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 ECM2YBR065C 1095 nt5.89□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 MLC2YPR188C 492 nt5.89□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.89□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 RIO1YOR119C 1455 nt5.89□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 KNH1YDL049C 807 nt5.88□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 CIS3YJL158C 684 nt5.88□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 PYC1YGL062W 3537 nt5.88□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YFL064CYFL064C 525 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 ERP2YAL007C 648 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YPR202WYPR202W 717 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 VPS4YPR173C 1314 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 RTT106YNL206C 1368 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 HXT2YMR011W 1626 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YMR155WYMR155W 1644 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 SLX5YDL013W 1860 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 NUD1YOR373W 2556 nt5.87□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YDL034WYDL034W 345 nt5.86□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 CAD1YDR423C 1230 nt5.86□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 COS9YKL219W 1224 nt5.86□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt5.86□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 BUL1YMR275C 2931 nt5.86□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 SMF2YHR050W 1650 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 TIM54YJL054W 1437 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 COX9YDL067C 180 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 VMA16YHR026W 642 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YJR115WYJR115W 510 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 CBT1YKL208W 816 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YKR073CYKR073C 321 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YLR118CYLR118C 684 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 TFS1YLR178C 660 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 PGA3YML125C 939 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YML131WYML131W 1098 nt5.85□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 ECM7YLR443W 1347 nt5.84□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 SNF11YDR073W 510 nt5.84□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YLL059CYLL059C 507 nt5.84□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.84□□□□□ -1.47
CTF3Q12748 YIL055CYIL055C 1884 nt5.83□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 SHE10YGL228W 1734 nt5.83□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 YDL057WYDL057W 987 nt5.83□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 SNZ3YFL059W 897 nt5.83□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 YKL151CYKL151C 1014 nt5.83□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 SNZ2YNL333W 897 nt5.83□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 YHR140WYHR140W 720 nt5.82□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 GAT4YIR013C 366 nt5.82□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 LDB18YLL049W 540 nt5.82□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 SEC13YLR208W 894 nt5.82□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 GFD1YMR255W 567 nt5.82□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 DOM34YNL001W 1161 nt5.82□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 UTP9YHR196W 1728 nt5.82□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 YEH1YLL012W 1722 nt5.82□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 YBR284WYBR284W 2394 nt5.81□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 ATG18YFR021W 1503 nt5.81□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 TRK2YKR050W 2670 nt5.81□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 ADE13YLR359W 1449 nt5.81□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 MID1YNL291C 1647 nt5.81□□□□□ -1.48
CTF3Q12748 GUS1YGL245W 2127 nt5.8□□□□□ -1.48
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