Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RIPPLY1Q0D2K3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RIPPLY1Q0D2K3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RIPPLY1Q0D2K3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms