Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP3CAQ08209 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP3CAQ08209 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms