Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK18Q07002 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDK18Q07002 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDK18Q07002 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms