Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNDQ07001 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNDQ07001 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHRNDQ07001 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNDQ07001 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms