Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRSF11Q05519 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRSF11Q05519 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRSF11Q05519 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms