Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTK2Q05397 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTK2Q05397 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTK2Q05397 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms