Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD164Q04900 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD164Q04900 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD164Q04900 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD164Q04900 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD164Q04900 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CD164Q04900 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CD164Q04900 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CD164Q04900 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CD164Q04900 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD164Q04900 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CD164Q04900 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD164Q04900 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD164Q04900 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms