Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 ERP2YAL007C 648 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SAM4YPL273W 978 nt6.68□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 DIA3YDL024C 1407 nt6.67□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 PGK1YCR012W 1251 nt6.67□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 BNS1YGR230W 414 nt6.67□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 CTF8YHR191C 402 nt6.67□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YUR1YJL139C 1287 nt6.67□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 ATP14YLR295C 375 nt6.67□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 NPL6YMR091C 1308 nt6.67□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 DRS1YLL008W 2259 nt6.66□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 SKI2YLR398C 3864 nt6.66□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YPK2YMR104C 2034 nt6.66□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YDL023CYDL023C 321 nt6.66□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 MNN5YJL186W 1761 nt6.66□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 MTC1YJL123C 1437 nt6.66□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 XBP1YIL101C 1944 nt6.66□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.65□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 LCP5YER127W 1074 nt6.65□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 YER186CYER186C 921 nt6.65□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 RPS2YGL123W 765 nt6.65□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 RME1YGR044C 903 nt6.65□□□□□ -1.34
SYF1Q04048 EEB1YPL095C 1371 nt6.65□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.65□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 LAG2YOL025W 1983 nt6.64□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 GET3YDL100C 1065 nt6.64□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 KSS1YGR040W 1107 nt6.64□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 CIS3YJL158C 684 nt6.64□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 VNX1YNL321W 2727 nt6.64□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 RAP1YNL216W 2484 nt6.64□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.63□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 ACS1YAL054C 2142 nt6.63□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 MMP1YLL061W 1752 nt6.63□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 ICT1YLR099C 1185 nt6.63□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 PGA3YML125C 939 nt6.63□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 TFB4YPR056W 1017 nt6.63□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 POP1YNL221C 2628 nt6.63□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 PDR18YNR070W 4002 nt6.62□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YMR027WYMR027W 1413 nt6.62□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt6.62□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 ICS3YJL077C 396 nt6.62□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 STM1YLR150W 822 nt6.62□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YOR342CYOR342C 960 nt6.62□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 CBC2YPL178W 627 nt6.62□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 KNS1YLL019C 2214 nt6.61□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 IPI1YHR085W 1005 nt6.61□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YML083CYML083C 1257 nt6.61□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 ERC1YHR032W 1746 nt6.61□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.6□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YHL017WYHL017W 1599 nt6.6□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 DEF1YKL054C 2217 nt6.6□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 SHE10YGL228W 1734 nt6.59□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 YNL296WYNL296W 315 nt6.59□□□□□ -1.35
SYF1Q04048 PHO3YBR092C 1404 nt6.59□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.58□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 ISC1YER019W 1434 nt6.58□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 YIL055CYIL055C 1884 nt6.58□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 IRS4YKR019C 1848 nt6.57□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 GPI11YDR302W 660 nt6.57□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 YGR127WYGR127W 939 nt6.57□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.57□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 YPR123CYPR123C 435 nt6.57□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 CSC1YLR241W 2349 nt6.57□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 HXK2YGL253W 1461 nt6.57□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 IES1YFL013C 2079 nt6.57□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 RIO1YOR119C 1455 nt6.56□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 UTR4YEL038W 684 nt6.56□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 MLC2YPR188C 492 nt6.56□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 HSP78YDR258C 2436 nt6.56□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 PHO8YDR481C 1701 nt6.56□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 COT1YOR316C 1320 nt6.55□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 ALT1YLR089C 1779 nt6.55□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 YHR145CYHR145C 357 nt6.55□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 MRS1YIR021W 1092 nt6.55□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 BBP1YPL255W 1158 nt6.55□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 PZF1YPR186C 1290 nt6.55□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 TRK2YKR050W 2670 nt6.54□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 SLX5YDL013W 1860 nt6.54□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 POM33YLL023C 840 nt6.54□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 ARA2YMR041C 1008 nt6.54□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 SCO2YBR024W 906 nt6.54□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 ETR1YBR026C 1143 nt6.54□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 BUL1YMR275C 2931 nt6.54□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 GAT1YFL021W 1533 nt6.54□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 MSS1YMR023C 1581 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 THI4YGR144W 981 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 YHR127WYHR127W 732 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 SLD7YOR060C 774 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 RPO26YPR187W 468 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 MSS116YDR194C 1995 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 HXT15YDL245C 1704 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 HXT16YJR158W 1704 nt6.53□□□□□ -1.36
SYF1Q04048 CSM2YIL132C 642 nt6.52□□□□□ -1.37
SYF1Q04048 SWP1YMR149W 861 nt6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 82 ms