Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ROM1Q03395 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ROM1Q03395 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ROM1Q03395 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms