Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NUCB1Q02818 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUCB1Q02818 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms