Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MUC3AQ02505 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3AQ02505 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms