Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRG1Q02297 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRG1Q02297 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRG1Q02297 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms