Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF17Q02223 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFRSF17Q02223 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF17Q02223 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms