Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPIBQ01892 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPIBQ01892 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPIBQ01892 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms