Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4F8P98187 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYP4F8P98187 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYP4F8P98187 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYP4F8P98187 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4F8P98187 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms