Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VLDLRP98155 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VLDLRP98155 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VLDLRP98155 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms