Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD3P84022 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD3P84022 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMAD3P84022 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms