Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTRA4P83105 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
HTRA4P83105 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTRA4P83105 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms