Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB2P80303 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB2P80303 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NUCB2P80303 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NUCB2P80303 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB2P80303 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB2P80303 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB2P80303 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB2P80303 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB2P80303 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB2P80303 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUCB2P80303 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUCB2P80303 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUCB2P80303 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUCB2P80303 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUCB2P80303 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB2P80303 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB2P80303 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB2P80303 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB2P80303 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB2P80303 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB2P80303 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB2P80303 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB2P80303 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB2P80303 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB2P80303 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB2P80303 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB2P80303 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB2P80303 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB2P80303 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB2P80303 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB2P80303 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB2P80303 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB2P80303 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB2P80303 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB2P80303 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB2P80303 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB2P80303 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB2P80303 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB2P80303 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms