Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-24P63145 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-24P63145 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-24P63145 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVK-24P63145 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-24P63145 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-24P63145 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-24P63145 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-24P63145 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-24P63145 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-24P63145 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERVK-24P63145 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ERVK-24P63145 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ERVK-24P63145 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-24P63145 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERVK-24P63145 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms