Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSPAN5P62079 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSPAN5P62079 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms