Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
ROMO1P60602 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ROMO1P60602 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms