Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN2P57739 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN2P57739 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN2P57739 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms