Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCBP3P57721 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCBP3P57721 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCBP3P57721 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms