Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BACE1P56817 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BACE1P56817 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BACE1P56817 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BACE1P56817 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BACE1P56817 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BACE1P56817 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BACE1P56817 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BACE1P56817 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BACE1P56817 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BACE1P56817 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BACE1P56817 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BACE1P56817 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BACE1P56817 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BACE1P56817 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BACE1P56817 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BACE1P56817 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BACE1P56817 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BACE1P56817 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BACE1P56817 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BACE1P56817 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BACE1P56817 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BACE1P56817 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BACE1P56817 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BACE1P56817 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BACE1P56817 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BACE1P56817 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BACE1P56817 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BACE1P56817 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BACE1P56817 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BACE1P56817 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BACE1P56817 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BACE1P56817 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
BACE1P56817 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BACE1P56817 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BACE1P56817 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BACE1P56817 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BACE1P56817 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BACE1P56817 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BACE1P56817 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BACE1P56817 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BACE1P56817 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BACE1P56817 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BACE1P56817 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BACE1P56817 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BACE1P56817 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BACE1P56817 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BACE1P56817 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BACE1P56817 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BACE1P56817 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
BACE1P56817 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BACE1P56817 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BACE1P56817 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BACE1P56817 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BACE1P56817 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BACE1P56817 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BACE1P56817 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BACE1P56817 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BACE1P56817 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BACE1P56817 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BACE1P56817 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BACE1P56817 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BACE1P56817 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BACE1P56817 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms