Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN8P56748 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN8P56748 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN8P56748 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms