Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP1S2P56377 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AP1S2P56377 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms