Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ELLP55199 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ELLP55199 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELLP55199 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELLP55199 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELLP55199 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELLP55199 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELLP55199 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ELLP55199 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELLP55199 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELLP55199 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELLP55199 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELLP55199 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELLP55199 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELLP55199 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ELLP55199 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ELLP55199 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ELLP55199 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ELLP55199 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELLP55199 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELLP55199 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELLP55199 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELLP55199 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELLP55199 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELLP55199 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ELLP55199 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ELLP55199 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms