Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LUMP51884 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LUMP51884 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LUMP51884 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LUMP51884 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LUMP51884 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LUMP51884 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LUMP51884 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LUMP51884 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LUMP51884 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LUMP51884 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LUMP51884 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LUMP51884 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LUMP51884 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LUMP51884 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LUMP51884 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LUMP51884 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LUMP51884 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LUMP51884 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LUMP51884 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LUMP51884 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LUMP51884 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LUMP51884 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LUMP51884 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LUMP51884 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LUMP51884 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LUMP51884 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LUMP51884 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LUMP51884 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LUMP51884 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LUMP51884 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LUMP51884 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LUMP51884 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LUMP51884 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LUMP51884 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LUMP51884 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LUMP51884 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LUMP51884 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LUMP51884 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LUMP51884 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LUMP51884 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LUMP51884 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LUMP51884 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LUMP51884 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LUMP51884 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LUMP51884 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LUMP51884 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LUMP51884 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LUMP51884 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LUMP51884 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LUMP51884 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LUMP51884 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LUMP51884 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LUMP51884 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LUMP51884 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms