Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APLP1P51693 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APLP1P51693 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APLP1P51693 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APLP1P51693 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APLP1P51693 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APLP1P51693 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APLP1P51693 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APLP1P51693 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APLP1P51693 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APLP1P51693 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APLP1P51693 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APLP1P51693 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
APLP1P51693 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APLP1P51693 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APLP1P51693 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APLP1P51693 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APLP1P51693 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APLP1P51693 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APLP1P51693 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APLP1P51693 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APLP1P51693 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APLP1P51693 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APLP1P51693 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APLP1P51693 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APLP1P51693 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APLP1P51693 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APLP1P51693 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APLP1P51693 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APLP1P51693 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APLP1P51693 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APLP1P51693 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APLP1P51693 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
APLP1P51693 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APLP1P51693 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APLP1P51693 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APLP1P51693 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APLP1P51693 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APLP1P51693 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APLP1P51693 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
APLP1P51693 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APLP1P51693 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APLP1P51693 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APLP1P51693 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP1P51693 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP1P51693 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP1P51693 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP1P51693 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP1P51693 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP1P51693 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP1P51693 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP1P51693 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP1P51693 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP1P51693 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP1P51693 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP1P51693 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP1P51693 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP1P51693 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP1P51693 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP1P51693 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP1P51693 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP1P51693 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP1P51693 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP1P51693 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP1P51693 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP1P51693 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP1P51693 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP1P51693 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP1P51693 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP1P51693 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APLP1P51693 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APLP1P51693 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APLP1P51693 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APLP1P51693 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
APLP1P51693 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APLP1P51693 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APLP1P51693 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APLP1P51693 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
APLP1P51693 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
APLP1P51693 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APLP1P51693 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APLP1P51693 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APLP1P51693 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APLP1P51693 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APLP1P51693 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
APLP1P51693 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APLP1P51693 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APLP1P51693 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APLP1P51693 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APLP1P51693 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
APLP1P51693 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP1P51693 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP1P51693 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP1P51693 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP1P51693 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP1P51693 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP1P51693 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP1P51693 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP1P51693 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP1P51693 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms