Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB27AP51159 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB27AP51159 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB27AP51159 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms