Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAMP50895 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCAMP50895 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BCAMP50895 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BCAMP50895 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BCAMP50895 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BCAMP50895 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BCAMP50895 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BCAMP50895 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAMP50895 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAMP50895 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAMP50895 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAMP50895 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAMP50895 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAMP50895 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAMP50895 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BCAMP50895 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BCAMP50895 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAMP50895 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAMP50895 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAMP50895 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAMP50895 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAMP50895 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BCAMP50895 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCAMP50895 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCAMP50895 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCAMP50895 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BCAMP50895 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAMP50895 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAMP50895 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAMP50895 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAMP50895 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAMP50895 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAMP50895 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAMP50895 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BCAMP50895 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCAMP50895 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BCAMP50895 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCAMP50895 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCAMP50895 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCAMP50895 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCAMP50895 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCAMP50895 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAMP50895 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAMP50895 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAMP50895 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAMP50895 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAMP50895 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCAMP50895 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCAMP50895 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCAMP50895 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCAMP50895 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAMP50895 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAMP50895 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAMP50895 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAMP50895 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAMP50895 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAMP50895 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAMP50895 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCAMP50895 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCAMP50895 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms