Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KNTC1P50748 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KNTC1P50748 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms