Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EMDP50402 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMDP50402 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMDP50402 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMDP50402 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EMDP50402 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMDP50402 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMDP50402 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EMDP50402 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EMDP50402 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMDP50402 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMDP50402 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EMDP50402 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EMDP50402 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EMDP50402 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EMDP50402 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EMDP50402 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMDP50402 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMDP50402 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMDP50402 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMDP50402 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms