Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CRIP1P50238 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CRIP1P50238 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms