Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPFP49454 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPFP49454 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPFP49454 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPFP49454 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPFP49454 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPFP49454 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPFP49454 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPFP49454 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPFP49454 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPFP49454 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPFP49454 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPFP49454 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPFP49454 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPFP49454 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPFP49454 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPFP49454 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPFP49454 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPFP49454 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPFP49454 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPFP49454 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPFP49454 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPFP49454 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPFP49454 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPFP49454 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPFP49454 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPFP49454 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPFP49454 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPFP49454 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPFP49454 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPFP49454 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPFP49454 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPFP49454 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPFP49454 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPFP49454 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPFP49454 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPFP49454 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPFP49454 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPFP49454 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPFP49454 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CENPFP49454 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPFP49454 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPFP49454 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPFP49454 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CENPFP49454 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPFP49454 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPFP49454 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPFP49454 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPFP49454 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPFP49454 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPFP49454 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPFP49454 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPFP49454 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPFP49454 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPFP49454 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPFP49454 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPFP49454 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPFP49454 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPFP49454 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPFP49454 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPFP49454 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPFP49454 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPFP49454 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPFP49454 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPFP49454 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPFP49454 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPFP49454 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPFP49454 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPFP49454 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPFP49454 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPFP49454 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPFP49454 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPFP49454 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPFP49454 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPFP49454 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPFP49454 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPFP49454 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPFP49454 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPFP49454 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPFP49454 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPFP49454 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPFP49454 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPFP49454 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPFP49454 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPFP49454 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPFP49454 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPFP49454 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPFP49454 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPFP49454 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms