Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PXNP49023 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PXNP49023 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PXNP49023 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PXNP49023 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PXNP49023 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PXNP49023 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PXNP49023 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PXNP49023 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PXNP49023 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PXNP49023 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PXNP49023 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PXNP49023 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PXNP49023 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PXNP49023 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PXNP49023 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PXNP49023 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PXNP49023 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PXNP49023 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PXNP49023 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PXNP49023 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PXNP49023 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PXNP49023 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PXNP49023 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PXNP49023 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PXNP49023 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PXNP49023 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PXNP49023 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PXNP49023 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PXNP49023 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PXNP49023 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PXNP49023 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PXNP49023 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PXNP49023 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PXNP49023 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PXNP49023 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PXNP49023 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PXNP49023 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PXNP49023 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PXNP49023 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PXNP49023 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PXNP49023 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PXNP49023 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PXNP49023 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PXNP49023 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PXNP49023 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PXNP49023 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PXNP49023 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PXNP49023 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PXNP49023 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PXNP49023 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PXNP49023 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PXNP49023 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PXNP49023 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PXNP49023 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PXNP49023 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PXNP49023 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PXNP49023 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PXNP49023 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PXNP49023 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PXNP49023 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PXNP49023 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PXNP49023 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PXNP49023 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PXNP49023 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PXNP49023 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PXNP49023 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PXNP49023 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PXNP49023 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PXNP49023 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PXNP49023 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PXNP49023 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PXNP49023 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PXNP49023 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PXNP49023 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PXNP49023 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PXNP49023 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PXNP49023 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PXNP49023 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PXNP49023 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PXNP49023 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PXNP49023 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PXNP49023 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms