Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD97P48960 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD97P48960 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD97P48960 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD97P48960 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD97P48960 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD97P48960 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD97P48960 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD97P48960 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD97P48960 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD97P48960 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD97P48960 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD97P48960 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD97P48960 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD97P48960 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD97P48960 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD97P48960 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD97P48960 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD97P48960 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD97P48960 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD97P48960 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD97P48960 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD97P48960 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD97P48960 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD97P48960 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD97P48960 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD97P48960 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD97P48960 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD97P48960 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CD97P48960 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD97P48960 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD97P48960 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD97P48960 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD97P48960 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD97P48960 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD97P48960 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD97P48960 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD97P48960 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD97P48960 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD97P48960 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD97P48960 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD97P48960 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD97P48960 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD97P48960 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD97P48960 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD97P48960 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD97P48960 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD97P48960 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD97P48960 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD97P48960 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD97P48960 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 615.2 ms