Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCT5P48643 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCT5P48643 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCT5P48643 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT5P48643 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT5P48643 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT5P48643 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT5P48643 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCT5P48643 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCT5P48643 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CCT5P48643 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCT5P48643 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT5P48643 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT5P48643 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT5P48643 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT5P48643 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT5P48643 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT5P48643 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCT5P48643 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT5P48643 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT5P48643 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT5P48643 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT5P48643 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT5P48643 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCT5P48643 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT5P48643 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT5P48643 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT5P48643 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT5P48643 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT5P48643 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCT5P48643 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCT5P48643 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1503 ms