Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NRIP1P48552 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRIP1P48552 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRIP1P48552 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRIP1P48552 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms