Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARCN1P48444 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARCN1P48444 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARCN1P48444 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms