Protein–RNA interactions for Protein: P48201

ATP5G3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G3P48201 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATP5G3P48201 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP5G3P48201 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP5G3P48201 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms