Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCTRP47872 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCTRP47872 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCTRP47872 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCTRP47872 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCTRP47872 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCTRP47872 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCTRP47872 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCTRP47872 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCTRP47872 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCTRP47872 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCTRP47872 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCTRP47872 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCTRP47872 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCTRP47872 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCTRP47872 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCTRP47872 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCTRP47872 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCTRP47872 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCTRP47872 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCTRP47872 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCTRP47872 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCTRP47872 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCTRP47872 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCTRP47872 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCTRP47872 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCTRP47872 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCTRP47872 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCTRP47872 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCTRP47872 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCTRP47872 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCTRP47872 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCTRP47872 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCTRP47872 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCTRP47872 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCTRP47872 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SCTRP47872 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCTRP47872 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCTRP47872 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCTRP47872 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCTRP47872 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCTRP47872 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCTRP47872 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCTRP47872 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCTRP47872 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCTRP47872 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCTRP47872 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCTRP47872 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCTRP47872 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCTRP47872 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCTRP47872 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCTRP47872 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCTRP47872 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCTRP47872 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms