Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGRP47804 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGRP47804 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGRP47804 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGRP47804 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGRP47804 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGRP47804 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGRP47804 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGRP47804 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGRP47804 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGRP47804 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGRP47804 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGRP47804 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGRP47804 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGRP47804 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGRP47804 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGRP47804 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGRP47804 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RGRP47804 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGRP47804 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGRP47804 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGRP47804 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGRP47804 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGRP47804 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGRP47804 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGRP47804 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RGRP47804 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGRP47804 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGRP47804 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGRP47804 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGRP47804 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGRP47804 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGRP47804 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGRP47804 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGRP47804 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGRP47804 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGRP47804 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGRP47804 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGRP47804 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGRP47804 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGRP47804 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGRP47804 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGRP47804 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGRP47804 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGRP47804 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGRP47804 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGRP47804 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGRP47804 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGRP47804 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGRP47804 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGRP47804 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGRP47804 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGRP47804 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RGRP47804 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGRP47804 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGRP47804 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RGRP47804 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RGRP47804 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms