Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MCAMP43121 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCAMP43121 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MCAMP43121 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCAMP43121 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCAMP43121 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MCAMP43121 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCAMP43121 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MCAMP43121 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCAMP43121 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCAMP43121 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MCAMP43121 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCAMP43121 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCAMP43121 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
MCAMP43121 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCAMP43121 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCAMP43121 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCAMP43121 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MCAMP43121 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCAMP43121 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCAMP43121 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MCAMP43121 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCAMP43121 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCAMP43121 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCAMP43121 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCAMP43121 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCAMP43121 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MCAMP43121 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCAMP43121 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCAMP43121 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MCAMP43121 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCAMP43121 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCAMP43121 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCAMP43121 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCAMP43121 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCAMP43121 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCAMP43121 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MCAMP43121 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MCAMP43121 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MCAMP43121 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCAMP43121 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCAMP43121 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCAMP43121 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCAMP43121 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MCAMP43121 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCAMP43121 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCAMP43121 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MCAMP43121 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCAMP43121 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCAMP43121 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCAMP43121 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCAMP43121 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MCAMP43121 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCAMP43121 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCAMP43121 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MCAMP43121 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MCAMP43121 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MCAMP43121 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCAMP43121 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCAMP43121 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCAMP43121 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MCAMP43121 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MCAMP43121 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MCAMP43121 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCAMP43121 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MCAMP43121 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCAMP43121 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCAMP43121 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MCAMP43121 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCAMP43121 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCAMP43121 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MCAMP43121 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCAMP43121 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCAMP43121 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCAMP43121 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCAMP43121 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCAMP43121 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MCAMP43121 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MCAMP43121 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCAMP43121 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCAMP43121 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCAMP43121 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCAMP43121 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MCAMP43121 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCAMP43121 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCAMP43121 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCAMP43121 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MCAMP43121 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCAMP43121 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCAMP43121 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MCAMP43121 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MCAMP43121 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms