Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTGER2P43116 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTGER2P43116 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTGER2P43116 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTGER2P43116 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms