Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDKN2BP42772 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN2BP42772 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN2BP42772 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms