Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA1P42261 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA1P42261 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA1P42261 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA1P42261 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms